Родился 8.04.1915 в селе Канищево ныне Рязанского района Рязанской области в семье рабочего. Русский. Член КПСС с 1944. Окончил 9 классов.
В Советской Армии с 1940. Окончил Оренбургскую военно-авиационную школу пилотов.
Участник Великой Отечественной войны с июня 1941.
Командир эскадрильи 173-го гвардейского штурмового авиаполка (11-я гшад, 16-я ВА, 1-й Белорусский фронт), гвардии капитан.
К 23 сентября 1944 года С.К.Хрюкин произвёл 139 успешных боевых вылетов на уничтожение живой силы и техники противника. Им лично уничтожено: танков – 9, автомашин – 6, повозок с грузами – 39, орудий полевой артиллерии – 17, зенитных точек – 16, подавлен огонь 6 батарей зенитной артиллерии, создано 24 очага пожаров, взорвано 4 склада с горючим и боеприпасами, миномётов – 13, паровозов – 3, железнодорожных вагонов – 6, дзотов – 3, мостов – 2, уничтожено до 390 человек живой силы противника. Сбил в воздухе один истребитель Ме-109 и один истребитель ФВ-190.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 23 февраля 1945 года за мужество и героизм, проявленные при нанесении штурмовых ударов по вражеским войскам и стратегическим объектам, Хрюкину Сергею Кузьмичу присвоено звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда» (№ 4910).
С 10 февраля по 4 апреля 1945 года С.К.Хрюкин принимал участие в Восточно-Померанской стратегической операции, а с 16 апреля по 8 мая – в Берлинской операции и в штурме Берлина.
После войны продолжал службу в ВВС. С 1955 года майор С.К.Xрюкин – в запасе.
Звание Героя Советского. Союза присвоено 23.02.45.
С 1955 майор Xрюкин — в запасе. Жил в Рязани.
Умер 23.12.1970.